员工进入公司后，公司为保障自身权益不受损失，会要求员工签订竞业限制协议。而一些人不在意，跳槽后又选择了同行业的工作，给原公司带来了竞争利益损失，属于违反竞业限制协议。那么，按照协议约定，员工违约之后要支付违约金给公司，所以必须得先明确违约金的计算。
实际中，员工违反竞业限制协议，并无明确规定违约金的计算。不过，双方有约定的从约定，没有约定的根据原公司的损失、公平原则来确定违约金。
通常情况下，可以参考如下方式计算：
1、以商业秘密被侵害遭受的实际损失作为赔偿额
如商业秘密被泄露后客户的丢失，导致应当签订的合同没有履行，为此造成损失的赔偿额。
2、以违约人违反约定所获得的全部收益作为赔偿额
比如原先约定好的合作方，被违反竞业限制约定的员工挖走，因此给原公司带来的利益损失。
3、以被擅自公开的商业秘密的全部价值作为赔偿额
因员工违约造成某个商业秘密完全公开，该商业秘密的全部价值即为赔偿损失的依据。并且商业秘密的全部价值，可由委托国家认可的无形资产评估机构评定。
4、以约定双倍或多倍返还竞业限制的补偿费为赔偿额
按规定，员工违反竞业限制约定，应当向原公司支付违约金，其数额不得超过原公司向员工支付的竞业限制经济补偿的三倍，不过目前该条款已经被删除，但可以作为参考。
5、以违反保守秘密和竞业限制所获得的收益为赔偿额
最后，当员工违反竞业限制协议后，为节省双方的时间跟精力，较为理想的处理方式，就是双方协商处理纠纷。如果确实无法协商或协商不成的，比如双方都难以确定违约金的，或是根本不知道怎么计算这笔数额的，那么建议可以在必要时找个专业律师介入。