乌克兰和俄罗斯合并后,总是受到波兰、土耳其和鞑靼和后来的瑞典人的干扰。他们通常的方法是拉拢一部分哥萨克贵族分子。
18世纪初,瑞典国王查理十二世企图通过乌克兰进军莫斯科,但是遭到乌克兰游击队的沉重打击。瑞典军队围攻波尔塔瓦堡垒两个月,没有成功,最终被赶来增援的彼得大帝的军队歼灭,迫使瑞典接受投降的命运。波尔塔瓦战役让瑞典和波兰将乌克兰从俄罗斯分裂出来的图谋破灭了。
乌克兰和俄罗斯的合并为乌克兰东部的经济发展创造了条件。俄罗斯大力开发了顿巴斯地区的煤矿,建设了火药厂和兵工厂 。18世纪初,乌克兰已经有了200多家大型企业。
但是,俄罗斯沙皇政府的民族沙文主义政策对乌克兰人的伤害也是巨大的。确定俄乌合并的《彼列雅斯拉夫协定》没有得到很好地执行,乌克兰自治权被蚕食殆尽。而扎波罗热营地的传统自治制度让沙皇非常不安,想方设法予以取消。彼得大帝和以后的叶卡特琳娜二世都对乌克兰的营地进行了镇压,1775年,叶卡特琳娜宣布扎波罗热营地不复存在。
1812年,征服了欧洲大部分地区的拿破仑开始进攻俄罗斯。按照拿破仑的计划,法国将在乌克兰进行殖民,并且大肆宣传废除乌克兰的农奴制度,但是当时的乌克兰人既不相信沙皇,也不相信拿破仑,对拿破仑的军队进行了顽强的抵抗。